目前環境部執行環境水質例行性監測，採全國分區委託合格檢測機構辦理。全國共執行河川85條，計304測點；水庫52座，計111測點；區域性地下水監測計460餘口。
環境水質監測作業每年約產出10萬餘筆水質監測數據，這些監測數據經過品保程序後，在「全國環境水質監測資訊網」公布供全民查閱。同時，建立長期水質變化趨勢資料並作為污染防治決策參考。
全國各地監測點位因地理環境等因素，水質濃度變化不一，較難透過單一標準判定是否異常，但可透過長期檢測數據趨勢，判定是否有濃度出現異常情形，在長期監測情況下可提早採取相對應預防措施，避免發生重大污染事件！