大部分的氮，起先都是以有機氮(蛋白質)及氨的形式存在，經過一段時間，有機氮會逐漸地轉化成氨氮，在此之後出現好氧情況，則氨會被氧化成亞硝酸鹽及硝酸鹽。當水中大部分是有機氮及氨氮時，代表水剛被污染不久，且最具危險性。